但是，作为当时主要的法西斯国家的日本每当提到那场战争的时候，主要都是提到他们在那场战争中所受到的伤害和很少提到对他国造成的巨大灾难，最重要的原因是他们有一个很好的理由---日本是第一个受到核武器，也是目前为止唯一一个受到核武器攻击的国家。美国在日本的广岛和长崎各投下的原子弹给日本带来了严重的伤害，最后导致约30万人的死亡。
日本就是借助这两颗原子弹的“威力”来装饰自己“受害者”的面目，每年的8月6日和9日，分别在广岛和长崎都有纪念活动，所谓揭开伤口，教育下一代。
但是，从1995年以来，世界各地，包括美国、俄罗斯、中国、英国、德国日本等国的历史学家和科学家，以及原来的政治家和军人，经过单独或是联合研究，发现美国在日本投放原子弹的历史记载存在许多的疑问，无论是在文字还是图象资料上都有诸多的困惑。主要问题是：一，由于B-29飞机的航程有限，原子弹的投放飞机的起飞地点选在距离日本较近的提尼安岛的美国空军基地上，从美国本土运送两颗原子弹到提尼安岛上的步骤是先运送到夏威夷，然后在运送到提尼安岛，由于当时飞机的航程和安全性的限制，这两步过程使用的只能是军舰，这两段路却有很大的危险性，因为虽然日本海军在美军的打击下几乎已经没有了战斗力，但是，日本海军却仍然相当数量的潜艇，即使在战争末期这些潜艇仍然偷袭美军的军舰，即运送原子弹的军舰随时有可能被日本潜艇偷袭，美国怎么会冒那么大的风险用军舰运送原子弹?
二，当时美国制造出的第一批原子弹只有三颗，其中一颗已经在1945年7月16日的新墨西哥州的原子弹实验厂实验，美国怎么敢用仅剩的两颗原子弹去攻击实际上已经没有任何还手之力的日本，而且还是以平民为主的城市呢?而且，美国在未来几个月内不要可能马上在造出原子弹，美国难道没有想到会有可能出现的有、突然事件吗?
三，当时，主要的原子物理的科学家包括爱因斯坦、费米甚至是奥本海默本人都极力反对使用这种威力过大的武器。美国政府难道一点也不尊重这些为他们研制核武器以后还得依赖的科学家的意见吗?
四，电影和照片资料的问题。有很多人看过广岛和长崎原子弹爆炸、后的电影和照片资料，但是，你只要有少许的常识和一些思考，你就回发现这些电影和照片资料中有着诸多的问题。原子弹爆炸过后谁有能力在强烈的核辐射区进行摄影或摄像，日本当时没有任何一种防辐射的装备。即使是少得可怜的电影资料还是有问题，你会发现一些“幸存者”在爆炸后从废墟中出来后排成行走路，似乎是经过训练的。另外，能在核武器的爆炸中幸存这本身就是不可思议的事。
五，
“幸存者”的迷惑。从战争结束到今天，从未发现过一个可以直接证明在广岛和长崎有过原子弹爆炸的人。有些“幸存者”只看到有大火产生，另一些“幸存者”以自己所谓“受到辐射烧伤的”伤痕，实际上只是火烧伤的痕迹。没有一个日本人能自身经历的的证据证明在广岛和长崎曾爆炸过原子弹。
六，数字的困惑。当时由于日本的个大城市都受到美国飞机的整天狂轰滥炸，大多数市民都跑到乡下躲避，广岛和长崎也是如此，实际上，据一个在广岛的日本老人介绍，1945年3月以后，在广岛市的市民已经不足五万人了。当他在四月离开广岛到乡下时，广岛的人已经寥寥无几了。当然长崎也是如此，而日本政府最后却称两颗原子弹最后造成近30万人死亡，着实在令人费解。
七，科学证据。美国和德国科学家在广岛和长崎两地进行了土样品的秘密采集，拿回国后经化验发现这些土的土质与普通土几乎没有区别，辐射计量并非超常。根本无法与在核实验基地所采集的土样品的辐射剂量相比。实际上，在受到严重辐射的土地上在几百年内不可能可以生长植物，人在该地区生活也相当危险，这与今天广岛的事实相悖。这更使人们困惑。
